Microscopía virtual.

Emblema de Microscopía Viertual REDMACRO

Antecedentes

El presente proyecto es producto del análisis colectivo realizado en 2021 (agosto- noviembre) por un grupo de especialistas en tecnología y educación que conformó el Grupo de Desarrollo Tecnológico de la Red de Marouniversidades. Este grupo inició conformado por las siguientes Universidades de la Red:

  • Universidad de la República de Uruguay (UdelaR)
  • Universidad de Buenos Aires (UBA)
  • Universidad Nacional de Córdoba (UNC)
  • Universidad Nacional de La Plata (UNLP)
  • Universidad Veracruzana (UV)
  • Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM)

A través de sesiones mensuales de trabajo, donde se presentaron diversos proyectos que atienden necesidades de la docencia universitaria mediante el apoyo de herramientas tecnológicas, se decidió iniciar la colaboración con el desarrollo de un Portal web de microscopía virtual con imágenes digitales que pueden aumentarse como en el microscopio real. Esta decisión obedece a que tanto la UdelaR como la UBA habían desarrollado microscopios virtuales durante la pandemia, la UNAM tenía ya varias colecciones de laminillas publicadas en repositorios y otras Universidades habían necesitado este tipo de herramienta para dar continuidad a la formación de los estudiantes a través de medios virtuales.

Desarrollo del proyecto

El proyecto, coordinado por la DGTIC-UNAM, se lleva a cabo con la participación activa de la UdelaR, la UBA, la UNC y la Universidad Nacional de Costa Rica (UNC). En conjunto, se propuso el siguiente

Objetivo

Construir un portal web con imágenes digitales de microscopía (microscopio virtual) que aporten las diferentes universidades participantes, con el propósito de contar con una herramienta para la docencia disponible de forma abierta. El proyecto tiene las siguientes características:

  • Parte de un desarrollo existente (Universidad de la República, Uruguay) para ampliar su alcance hacia otras temáticas.
  • Se sustenta en la colaboración con diferentes facultades de las universidades participantes, tanto para compartir como para producir nuevas imágenes en diferentes áreas de las ciencias biológicas y de la salud.
  • Como herramienta para la docencia, se organiza en función de los contenidos de diversas asignaturas de carreras del área.
  • Las imágenes pueden ser exploradas simulando un microscopio para encontrar diversas estructuras en los tejidos, sin perder definición.

En el Grupo de Desarrollo Tecnológico para la Docencia, dentro de la Red, concebimos el uso de tecnología en la educación como una herramienta que permite realizar actividades de aprendizaje con funcionalidades que no podrían tenerse sin la tecnología. En este proyecto en particular, las imágenes digitales de microscopía permiten a los estudiantes observar los preparados y realizar aumentos tal como en un microscopio físico. Sin embargo, se les ofrece una ventaja: al mismo tiempo que observan una sección específica del preparado, mantienen siempre la referencia del lugar donde está ubicada la estructura que están observando:

Cerebro Nisil
Cerebro-Nissl. Departamento de Histología y Embriología. Facultad de Medicina. UdelaR. https://www.microscopiovirtual.net/microscopio/cerebrocoronal_nissl.htm?x=12589&y=16098&z=6 2022.

En el microscopio físico las imágenes se amplían y se pierde vista la muestra total, lo que comúnmente hace que los estudiantes no comprendan qué están observando. En este sentido, esta herramienta digital permite hacer algo que no puede hacerse sin ella, contribuyendo al aprendizaje de forma significativa. Por lo anterior, el microscopio virtual no sólo es útil para la enseñanza en línea o a distancia, sino también como herramienta para la enseñanza presencial.

Alcances

  • La consolidación del microscopio con los acuerdos entre universidades para el intercambio de imágenes bien categorizadas y catalogadas con un estándar que permita la interoperabilidad.
  • La generación de una estrategia de almacenamiento común.
  • El desarrollo de un portal web para dar acceso a los usuarios

Avances

  • Estándar de metadatos definido y aprobado por los especialistas en ciencias de la salud.
  • Arquitectura de la información acordada: repositorios locales en cada universidad que son cosechados por un repositorio concentrador desarrollado en la DGTIC- UNAM.
  • Almacenamiento y despliegue de imágenes a través del software IIPImage, instalado en los centros de datos de cada universidad.
  • Imágenes de alta resolución en formato .tiff, avaladas por las universidades participantes.
  • Portal web, actualmente en desarrollo por parte de la DGTIC-UNAM.
  • Liberación del prototipo funcional del Portal, 28 de junio de 2023.

Acciones futuras

  • Integrar las colecciones completas de la UdelaR, la UBA, la UNAM, la UNCórdoba y la UNCosta Rica.
  • Continuar el desarrollo del Portal integrando la funcionalidad de navegación dentro de las imágenes, a partir de la descripción de su contenido. Esta descripción debe ser desarrollada por los docentes, quienes pueden indicar qué es lo que deben observar los estudiantes.
  • Liberar la primera versión del portal en el semestre agosto-diciembre.
  • Firmar un convenio específico entre las universidades participantes, la UNAM y la UNAL para dar continuidad al proyecto y establecer los lineamientos y compromisos de las universidades que quieran integrarse compartiendo sus imágenes.
  • Realizar una evaluación del Portal con usuarios de las universidades participantes (estudiantes y docentes).